194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1275 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 319 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.42 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.7 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.65 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.35 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.64 
 
 		 257 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  47.45 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.96 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  55.95 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.27 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  61.68 
 
 		 252 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  43.82 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.41 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  38.64 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.72 
 
 		 237 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 262 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.7 
 
 		 250 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.24 
 
 		 249 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  38.73 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.48 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  41.06 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.15 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  35.65 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.78 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.95 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  37.3 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  37.3 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  37.3 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  31.62 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.68 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.15 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.51 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.71 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.91 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.98 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.65 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.88 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.65 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.39 
 
 		 254 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.39 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  46.55 
 
 		 229 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.62 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.34 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.71 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.1 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.49 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.54 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.88 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.6 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.05 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  34.03 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.54 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.08 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.36 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.2 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.7 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.19 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.26 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.65 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.31 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.93 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.75 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.31 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.78 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.57 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.98 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.03 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.64 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.82 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.69 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.59 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  37.12 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.05 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.73 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.11 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.27 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32.8 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.61 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32.8 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.15 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.69 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.06 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.73 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>