191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1526 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 250 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.71 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  42.11 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.67 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  44.98 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  44.98 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  44.98 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  43.65 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  44.18 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.69 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.37 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.71 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.23 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.02 
 
 		 278 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  39.59 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.45 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.47 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.94 
 
 		 323 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.78 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.56 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  31.05 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  24.7 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.17 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.72 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.93 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.85 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.46 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  25.88 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  31.1 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  31.15 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.08 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.16 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.46 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.4 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  28.19 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  29.12 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.64 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.68 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  30.74 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  27.82 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.13 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.39 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.59 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  30.29 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  29.32 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.34 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.22 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  27.84 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.14 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.65 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  28.68 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.18 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.4 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  28.35 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  26.81 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.92 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.92 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.27 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  29.64 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.38 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.58 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.01 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.22 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.54 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  30.64 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.62 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  25.2 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.69 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.12 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.84 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  23.69 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.37 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.14 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  25.2 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.27 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  26.24 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.3 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.21 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.22 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  25 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.58 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>