229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3314 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 257 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  89.11 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.09 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.25 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  50 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.59 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.83 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  52.5 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  44.87 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  52.54 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  43.33 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  43.33 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.63 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  42.92 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.94 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  46.25 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  54.47 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.7 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  44.19 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.8 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.91 
 
 		 319 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.03 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  39.58 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.89 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.91 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.96 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.24 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.27 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  35.1 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  41.08 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.54 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.3 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  35.06 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.96 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  34.23 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  33.97 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.56 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.24 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  37.93 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.34 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.25 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.92 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.64 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.64 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  35.22 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.43 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.13 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.18 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.12 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.94 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.22 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  30.71 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.71 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.47 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.1 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.51 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.88 
 
 		 282 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.8 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  30.45 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.72 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.86 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  33.79 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  34.4 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  34.4 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.98 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.26 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.72 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  32.93 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  34 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.08 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  36.03 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.94 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.93 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  29.6 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.58 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.15 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  32.5 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.85 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.25 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>