219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0166 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 255 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  54.09 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  49.43 
 
 		 323 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.57 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  49.36 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.67 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.08 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.27 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.04 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.58 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.15 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  45.41 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  39.16 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.59 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  44.07 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.48 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  41.62 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  46.47 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  46.47 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  46.47 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.12 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.22 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50.48 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.92 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  41.08 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.13 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.94 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.67 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.36 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.7 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.51 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.01 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.49 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.49 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.49 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0787  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.12 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00056745  normal  0.0562894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1973  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.71 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.541001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.51 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.02 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.57 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  35.98 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.46 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.2 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  36.32 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.49 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  35.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  35.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  41.21 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  35.79 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  32.82 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.07 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  51.52 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.36 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.55 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  39.55 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  29.33 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  31.68 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.55 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.43 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.82 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.97 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.42 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.8 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.81 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.48 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  35.48 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.81 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.84 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.43 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  50 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0846  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.29 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.862603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  31.03 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  48.03 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.64 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.87 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  31.22 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.24 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.87 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  31.7 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  31.7 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.8 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.15 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.65 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1024  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.18 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.22 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.6 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.63 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>