217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3090 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 
252 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  57.22 
 
 
323 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50 
 
 
259 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48.83 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.86 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.75 
 
 
278 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.61 
 
 
278 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.83 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  61.9 
 
 
319 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50.42 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.75 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  43.92 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.39 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.75 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.37 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.89 
 
 
250 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.94 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.08 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  39.34 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  44.02 
 
 
243 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.67 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  43.98 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.56 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  40.49 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.74 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.89 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.79 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.29 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.5 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.46 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.7 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.77 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  36.73 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.59 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  36.73 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  29.13 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.7 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  36.73 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.58 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  37.38 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.65 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.54 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.57 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  32.07 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.65 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.65 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.23 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.65 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.2 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.2 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.2 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.2 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.74 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  37.3 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.91 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.36 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.36 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.75 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.87 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.67 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.36 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.13 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  54.02 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.91 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.26 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.71 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.71 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  34.55 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  33.02 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.36 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.67 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  32.26 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.01 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.5 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.66 
 
 
290 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  44.68 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  31.47 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.65 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.02 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.77 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.57 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  34.56 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.2 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.83 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.91 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  39.23 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.84 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.96 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  30.12 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.14 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.22 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.83 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  31.82 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>