231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3546 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 257 aa  461  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  89.11 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.27 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.41 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  52.92 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48.76 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  42.25 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  51.63 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.75 
 
 		 278 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  42.68 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  42.68 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  42.99 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  42.19 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  47.92 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.18 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.77 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.89 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  41.99 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50.2 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.65 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.95 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.92 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  39.58 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  34.96 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  29.61 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.55 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  36.55 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.92 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.55 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.92 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  36.14 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.56 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.5 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  34.32 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  32.16 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.08 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  35.37 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  35.37 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.74 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.1 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.61 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  34.78 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.84 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.79 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.98 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.74 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  34.27 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  38.61 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.32 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  31.4 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.8 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.41 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.18 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.32 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.98 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  28.74 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.36 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  33.87 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  35.47 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.88 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.15 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.29 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.52 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  34.68 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.2 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.72 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  41.09 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  31.85 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.94 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  31.05 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  38.72 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.28 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  34.57 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.78 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.16 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  32.11 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  31.98 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.62 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.36 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.98 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.98 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.35 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.75 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>