235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0996 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 
253 aa  453  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  58.95 
 
 
323 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  48.63 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.74 
 
 
259 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  51.67 
 
 
257 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.11 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.34 
 
 
255 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.73 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.79 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  53.62 
 
 
252 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  49.44 
 
 
319 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.97 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.19 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  41.03 
 
 
249 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.14 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  45.92 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.75 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.24 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  36.76 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.9 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.86 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.02 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.02 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.02 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.02 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  35.71 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  35.71 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  37.25 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.71 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  32.8 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  35.37 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  34.6 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34.6 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34.6 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34.6 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.59 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.44 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.29 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.19 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.69 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.51 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  35.77 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  39.47 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.32 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.14 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  39.47 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  39.47 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.97 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  35 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.79 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.56 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.23 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.47 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.95 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.48 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.54 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  32.34 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.55 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.61 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.16 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  40.56 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  38.33 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.72 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  33.62 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.66 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  29.41 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.03 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.39 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.52 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.67 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.23 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  38.24 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  32.82 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  32.26 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.35 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.6 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.05 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.96 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.05 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.99 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.77 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.22 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.28 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.6 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.6 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.46 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.84 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.91 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.43 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  31.2 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.89 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.76 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.85 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.75 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.73 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.16 
 
 
269 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.71 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>