225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3317 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  99.6 
 
 
248 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  99.6 
 
 
248 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  100 
 
 
248 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  65.73 
 
 
243 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  64.37 
 
 
243 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  60 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  52.02 
 
 
237 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.8 
 
 
250 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.66 
 
 
261 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.16 
 
 
275 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.89 
 
 
257 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.81 
 
 
255 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.67 
 
 
257 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.99 
 
 
259 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.25 
 
 
278 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  37.1 
 
 
271 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.74 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  34.01 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.61 
 
 
270 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.4 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.59 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.47 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.11 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  31.98 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  31.8 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  31.98 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.98 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.58 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  31.58 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.05 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.5 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.65 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.65 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.2 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.69 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.97 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.53 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.36 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  31.54 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.46 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  32.42 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.17 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.71 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.22 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.26 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  34.88 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.94 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.63 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.4 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.69 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  31.87 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.12 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.4 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.87 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.58 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  30.98 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2258  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.22 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.05 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.69 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  30.67 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.9 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.6 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.13 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  26.91 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.96 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  28.02 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  30.89 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  30.95 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.83 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.38 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.03 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.62 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.03 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  31.91 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.2 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.41 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  35.17 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.27 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.61 
 
 
248 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.35 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  28.93 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.2 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.54 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.83 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.28 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.64 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.1 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.88 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>