160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2258 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2258  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.7 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2704  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.1 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.8 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2247  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.55 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  31.76 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.43 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.74 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.65 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.71 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.6 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.65 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  30.5 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  30.5 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.86 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  31.89 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  30.21 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  27.84 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  34.15 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  37.61 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.45 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.78 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.14 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.69 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.74 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  26.72 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  36.36 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.59 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.58 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  34.23 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.91 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  34.23 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  35.43 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.44 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.9 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.96 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  23.44 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.29 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.31 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.27 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.64 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  32.09 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.07 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  33.19 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.24 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  33.19 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50.94 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.05 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.12 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.64 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  27.59 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  31.11 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.87 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.21 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.29 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  34.19 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0422  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.65 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.29 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.06 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  29.5 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.69 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.63 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.08 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.18 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.67 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.17 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.88 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.27 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.26 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.82 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.21 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  27.96 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  47.73 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  33.85 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.15 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  29.95 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>