206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1839 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 		 259 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.54 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  56.5 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3131  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.51 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0389088  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08520  cobalamin-5-phosphate synthase  45.53 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0996  cobalamin-5'-phosphate synthase  49.38 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3546  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  48 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0872247  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.62 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0166  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.86 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3090  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.64 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000185434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3314  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.06 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282641  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1275  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.55 
 
 		 319 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1357  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.55 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.356265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.06 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0946  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  47.15 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3317  cobalamin synthase  39.02 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3306  cobalamin synthase  39.02 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3368  cobalamin synthase  39.02 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  38.74 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1526  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.88 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.833751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2941  cobalamin synthase  42.35 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.6 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.08 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.08 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  31.47 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  31.47 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  31.47 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  31.47 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.27 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  32.27 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0585  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.31 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.39 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3572  cobalamin synthase  38.58 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0400887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.75 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.12 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.32 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.85 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.39 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.64 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.89 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.99 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.47 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  31.08 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2511  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.8 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.54 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  31.78 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.86 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.96 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.1 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.95 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  31.47 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.69 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.08 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.21 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.8 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  35.5 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.51 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.66 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.46 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  35.5 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  35.5 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.11 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  36.51 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.68 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.39 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  50.7 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.8 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.68 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.73 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  42.39 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  37.08 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  43.16 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  41.54 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.94 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.98 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.98 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.82 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.77 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.37 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.13 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.06 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  27.69 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.1 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.04 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.13 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  34.36 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  27.27 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  31.05 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  31.88 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.44 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>