209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3406 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  81.74 
 
 		 245 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2367  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  52.84 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.415535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.98 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.52 
 
 		 251 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.17 
 
 		 251 aa  98.2  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.3 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.09 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.89 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  32.78 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  34.96 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.76 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  33.19 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.19 
 
 		 268 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.71 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  30.51 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.6 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  30.86 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  35.04 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.55 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  30.64 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.17 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  37.99 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.82 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.51 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  37.6 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  25.21 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.41 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  29.25 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.91 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  29.11 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.78 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  29.41 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  30.86 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  37.96 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  28.11 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0842  cobalamin synthase  36.15 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.45 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  33.86 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0689  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1192  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.69 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2323  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.358925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2963  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1032  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1038  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1635  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.186551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  30.2 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  30.2 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  30.2 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  31.05 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  32.65 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  29.49 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.32 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.06 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  39.73 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  28.09 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  32.64 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0838  cobalamin synthase  32.73 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  34 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.96 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  34 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  27.64 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  34 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.28 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  39.73 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.84 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1839  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.96 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  32.64 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.03 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  30.56 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  37.55 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.44 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  27.45 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.97 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.2 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  40.59 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.95 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  35.11 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.15 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.96 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>