237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2710 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 247 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  51.23 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  49.17 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.2 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.8 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.54 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  36.73 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  31.98 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  32.14 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  32.14 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  32.14 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  35.39 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.36 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.08 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  35.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  33.62 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  31.75 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.27 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.91 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.74 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.84 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.51 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.87 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  31.82 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.44 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  31.49 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  32.79 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  32.92 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.64 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.75 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.44 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.31 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  31.62 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  30.77 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.85 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.22 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.85 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.55 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  34.27 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  31.71 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.18 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.21 
 
 		 270 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.95 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.31 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  34.47 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.77 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  31.15 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  31.93 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3406  hypothetical protein  35.2 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286076  normal  0.20657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1392  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.15 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2070  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.61 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0599586 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.04 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.43 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.35 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  28.21 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.19 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.47 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.89 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  38.46 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.87 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  32.08 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.76 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.03 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0866  cobalamin synthase  34.01 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.84 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  34.57 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.19 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.87 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.86 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.1 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.18 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.42 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.94 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.4 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  30.42 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  38.02 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.97 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  32.49 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.04 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.98 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.57 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>