198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03491 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  96.37 
 
 
193 aa  324  6e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.46 
 
 
246 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  41.36 
 
 
233 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.11 
 
 
246 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  46.32 
 
 
268 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02931  cobalamin-5-phosphate synthase  42.2 
 
 
170 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  36.9 
 
 
252 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.91 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.52 
 
 
251 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  35.64 
 
 
264 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.56 
 
 
260 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  33.16 
 
 
260 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  33.16 
 
 
260 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.45 
 
 
255 aa  94.4  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  34.62 
 
 
256 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  34.24 
 
 
254 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  35.09 
 
 
251 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.09 
 
 
249 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.6 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  32.28 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.8 
 
 
248 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.88 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.73 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.28 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.28 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  27.18 
 
 
262 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  28.72 
 
 
261 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.46 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.09 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.25 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.84 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.35 
 
 
251 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  29.1 
 
 
295 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.06 
 
 
257 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.7 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  45.9 
 
 
270 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.73 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.32 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.87 
 
 
240 aa  59.3  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0941  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.67 
 
 
272 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.374323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  27.27 
 
 
256 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  27.92 
 
 
262 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  27.92 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.12 
 
 
261 aa  58.2  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  27.92 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  27.92 
 
 
262 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  53.45 
 
 
255 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.44 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.94 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  27.41 
 
 
262 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  24.73 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.68 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  49.12 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  50 
 
 
260 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.81 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  43.28 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.32 
 
 
264 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  44.62 
 
 
278 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.23 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  42.86 
 
 
261 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  40 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  27.18 
 
 
262 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  27.18 
 
 
262 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  27.18 
 
 
262 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  46.03 
 
 
259 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.76 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.81 
 
 
275 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12236  cobalamin synthase  44.07 
 
 
249 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.144082  normal  0.239675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  23.76 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2697  cobalamin 5'-phosphate synthase  46.97 
 
 
275 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.71 
 
 
251 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  26.92 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1259  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.88 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.12 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  27.47 
 
 
247 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.37 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.27 
 
 
246 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 
251 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  26.37 
 
 
240 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.93 
 
 
251 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  25 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.95 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.34 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.67 
 
 
249 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  26.37 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  26.37 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2319  cobalamin synthase  46.3 
 
 
260 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  50.94 
 
 
257 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.76 
 
 
261 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.68 
 
 
255 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  24.08 
 
 
247 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  41.38 
 
 
256 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  50 
 
 
240 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.94 
 
 
250 aa  51.6  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.77 
 
 
323 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.44 
 
 
247 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.26 
 
 
278 aa  51.6  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.51 
 
 
248 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  23.04 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>