58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02931 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02931  cobalamin-5-phosphate synthase  100 
 
 
170 aa  331  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  92.35 
 
 
246 aa  289  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  94.71 
 
 
246 aa  267  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  68.24 
 
 
233 aa  223  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.77 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.37 
 
 
193 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.33 
 
 
268 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.8 
 
 
260 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.19 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.25 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.82 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.88 
 
 
255 aa  58.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  26.47 
 
 
256 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  33.72 
 
 
254 aa  57.4  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.99 
 
 
249 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  30.12 
 
 
251 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.94 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.9 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.56 
 
 
264 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.98 
 
 
249 aa  50.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  29.63 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  26.63 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  26.63 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.71 
 
 
256 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.08 
 
 
251 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  22.22 
 
 
270 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.64 
 
 
267 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1090  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.19 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181671  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.38 
 
 
253 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2427  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.19 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.01359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.86 
 
 
249 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  23.31 
 
 
247 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  23.93 
 
 
247 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  23.31 
 
 
240 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  20.73 
 
 
275 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.7 
 
 
250 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  23.31 
 
 
247 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  23.31 
 
 
247 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  22.91 
 
 
261 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  25.15 
 
 
260 aa  44.7  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.11 
 
 
224 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  27.22 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.4 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  22.36 
 
 
259 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  25.58 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.09 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.73 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.31 
 
 
240 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  29.71 
 
 
224 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.33 
 
 
257 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.43 
 
 
252 aa  40.8  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>