113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2092 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 
271 aa  531  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  51.08 
 
 
280 aa  268  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.7 
 
 
246 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.98 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.68 
 
 
243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.33 
 
 
241 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.48 
 
 
247 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.35 
 
 
257 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.74 
 
 
236 aa  92.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.97 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.35 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.05 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.41 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.21 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.55 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.82 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.27 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.91 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.7 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.78 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.31 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.83 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.56 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.38 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.38 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.61 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.45 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  24.9 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.1 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.62 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  25.38 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.46 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  23.42 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.91 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  24.55 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.36 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.31 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.41 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  25.91 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.91 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  25.51 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.76 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  25.91 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  23.05 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  25.1 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  25.1 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  26.62 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  26.62 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  26.62 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  25.51 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  25.51 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  25.51 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  25.51 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  24.69 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  24.69 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  24.69 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  25.59 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.48 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.82 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  24.28 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  23.9 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.85 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.16 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  28.57 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.02 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.64 
 
 
275 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  25.38 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  27 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.63 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  27 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  27 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  24 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  26.62 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.69 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  26.62 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  25 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.86 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.53 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3068  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  23.73 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.332139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.69 
 
 
251 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  25.51 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  25.1 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  23.74 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.11 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.34 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.64 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.89 
 
 
250 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  23.79 
 
 
282 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.6 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.32 
 
 
259 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  22.66 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.15 
 
 
268 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  20.99 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  21.51 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.77 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  31.25 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>