91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1535 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 217 aa  423  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  59.07 
 
 		 227 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  58.14 
 
 		 216 aa  191  7e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.18 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.88 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.5 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.27 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.61 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.47 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.07 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.4 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.39 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.05 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 257 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.52 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.39 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  30.69 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.64 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.98 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.47 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.38 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  30.73 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  30.73 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  30.73 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  30.73 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.95 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1718  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.2 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.659499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  29.94 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.79 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  29.94 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.95 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.53 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  26.82 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  30.64 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  30.06 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  30.06 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  30.06 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.46 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  29.41 
 
 		 259 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  30.06 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.28 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.16 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.17 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.36 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.52 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.62 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.41 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.41 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.26 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.98 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.94 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.91 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  26.36 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.65 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.54 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.89 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  36.47 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.49 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.99 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.34 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  28.81 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  28.65 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.38 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.83 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.73 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.65 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.1 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.92 
 
 		 273 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  27.44 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.4 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1698  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.35 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  55.56 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0871  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  25.44 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.72 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  50 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  27.22 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  40 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  54.05 
 
 		 245 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2710  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.28 
 
 		 247 aa  42  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.752805  normal  0.565232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  25.74 
 
 		 264 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  54.05 
 
 		 245 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0910  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.61 
 
 		 275 aa  42  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  27.06 
 
 		 257 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.81 
 
 		 256 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>