121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0701 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 236 aa  460  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  56.17 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  47.14 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.88 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.9 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.28 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.02 
 
 		 280 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.22 
 
 		 253 aa  88.6  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.31 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.47 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.91 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.65 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.65 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.03 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.42 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  28.45 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.64 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  24.17 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.78 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.04 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.31 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.57 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.74 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  29.03 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.61 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.89 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  27.87 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.67 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.24 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.29 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.69 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.69 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.75 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.46 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.87 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.8 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.46 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2206  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.11 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.73 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  25.73 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  35.25 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.33 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.36 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.44 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.27 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.31 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.65 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.91 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  25.33 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.95 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  26.75 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  26.75 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.25 
 
 		 261 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.87 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0857  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  26.13 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.4 
 
 		 277 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.89 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.05 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.78 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.54 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  25.91 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  27.05 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.86 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.46 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  25.51 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  25.51 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  26.02 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0089  cobalamin 5'-phosphate synthase  20.85 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  25.61 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.09 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.15 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0877  cobalamin synthase  26.38 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.97 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  27.05 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  27.05 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  27.05 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  27.05 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  26.38 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.18 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.41 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  37.5 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3774  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.65 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.81 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  28.82 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  26.38 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.68 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  30.25 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  24.68 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.5 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.27 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  25 
 
 		 248 aa  45.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.4 
 
 		 275 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.56 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0668  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.7 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>