143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2834 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2834  cobalamin 5'-phosphate synthase  100 
 
 		 253 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0988  cobalamin 5'-phosphate synthase  70.85 
 
 		 253 aa  321  8e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2496  cobalamin 5'-phosphate synthase  55.24 
 
 		 246 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0589206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0233  cobalamin 5'-phosphate synthase  50 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0143  cobalamin 5'-phosphate synthase  51.36 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.896826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1590  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.14 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0185  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.17 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0745  cobalamin-5'-phosphate synthase  27.09 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1717  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.87 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0936793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2092  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.1 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1443  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.58 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1017  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.17 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.244998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3456  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.63 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.78149  normal  0.171935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0251  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.81 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.722898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0733  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.32 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1582  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.27 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1180  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.42 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.49 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  31.65 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  31.65 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  31.65 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0701  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.91 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.216736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  26.96 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  31.22 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  31.22 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  31.22 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  31.22 
 
 		 247 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1550  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.98 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.03 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  32.53 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0238  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.47 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.885371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1370  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.64 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.81 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  30.16 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  29.71 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.69 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.69 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1535  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.35 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.055541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  30.98 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  22.46 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.02 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  26.8 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.97 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  30.8 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.45 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  28.87 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.27 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.44 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  28.45 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  28.45 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  28.45 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0513  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.75 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  25 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2302  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.73 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.34 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  32.02 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  32.41 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  32.02 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.71 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  32.41 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  30.83 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.19 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0289  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.26 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0928  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.24 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.707395  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.91 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.23 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.42 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.64 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  29.81 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0678  cobalamin-5'-phosphate synthase  30.5 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0518916  normal  0.202661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.9 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  28.86 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1107  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.97 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.76 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  28.4 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21100  cobalamin-5-phosphate synthase  31.05 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2385  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  32.28 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.3 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.48 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0198  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.29 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  30.04 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.51 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.79 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  39.66 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.19 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.25 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  28.21 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0968  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.63 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0641  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.8 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1368  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.29 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2155  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.8 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0657  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.79 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00645782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.75 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  25 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  27.71 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.48 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.91 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  29.2 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>