233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  100 
 
 		 245 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  95.51 
 
 		 245 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  61.92 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  65.45 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  56.05 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  58.56 
 
 		 243 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  60.36 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  60.09 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  61.6 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  62.27 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33030  cobalamin synthase  66.24 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  51.06 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  50.66 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  47.69 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  55.79 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  48.36 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.92 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.07 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  35.25 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.56 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.25 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.25 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  36.1 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  36.1 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.16 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.16 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.68 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  32.66 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  35.68 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  31.76 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.45 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.35 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2816  cobalamin synthase  42.98 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0135582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.4 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0577  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.14 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000147618  unclonable  0.0000000241437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.17 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.9 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.84 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  33.73 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  38.67 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  34.16 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  35 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  35.54 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  36.78 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  26.91 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.53 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.62 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  35.96 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  32.67 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2204  cobalamin synthase  32.26 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.151172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0099  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.1 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2396  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980528  normal  0.106018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.75 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  34.94 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  32.4 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.76 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  34.6 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  35.42 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  32.55 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  34.9 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  31.73 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  34.26 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  30.89 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  31.15 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.71 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0520  cobalamin-5'-phosphate synthase  40.07 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.228325  normal  0.0120715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.35 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.88 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.1 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.79 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.13 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.47 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.87 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1680  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.5 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.82805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  43.28 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  31.44 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.98 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0740  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.07 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  40.36 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2082  cobalamin synthase  34.02 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439271  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.08 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.11 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.32 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.82 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>