235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33030  cobalamin synthase  100 
 
 		 251 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3672  cobalamin synthase  67.11 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00479037  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1717  cobalamin (5'-phosphate) synthase  67.11 
 
 		 243 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1650  cobalamin synthase  68.46 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30893  hitchhiker  0.00536352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47650  cobalamin synthase  67.36 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4108  cobalamin synthase  66.95 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1681  cobalamin synthase  69.26 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4038  cobalamin synthase  70.12 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1280  cobalamin synthase  69.29 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1240  cobalamin synthase  68.46 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.436418  normal  0.920424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1759  cobalamin synthase  67.42 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1856  cobalamin synthase  48.71 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656817  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0465  cobalamin synthase  54.91 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1452  cobalamin 5'-phosphate synthase  54.2 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01926  cobalamin synthase  51.87 
 
 		 244 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3278  cobalamin synthase  46.03 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  36.78 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  35.63 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.54 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.05 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4390  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.34 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  40.26 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4186  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.36 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  34.58 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.86 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3812  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.83 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  34.91 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.47 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4584  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.06 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0485  cobalamin 5'-phosphate synthase  37.07 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  33.63 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.1 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3896  cobalamin 5'-phosphate synthase  39.39 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0267301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0173  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.68 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3083  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.29 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1313  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.63 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2816  cobalamin synthase  48.52 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0135582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.91 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2807  cobalamin 5'-phosphate synthase  38.91 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.204808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.92 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  31.45 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  33.99 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.61 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.3 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  34.4 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2383  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.02 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.59 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.99 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0326  cobalamin-5'-phosphate synthase  36.65 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  33.88 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  36.17 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  39.62 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  36.17 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  36.17 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  35.95 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  27.92 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2209  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3498  cobalamin synthase  31.09 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  33.06 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0468  cobalamin-5'-phosphate synthase  37.14 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.46 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2500  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.96 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3008  cobalamin 5'-phosphate synthase  41.2 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.18 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5783  cobalamin synthase  33.47 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0844  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.95 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0631  cobalamin-5'-phosphate synthase  32.3 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.359173  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2610  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.43 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2457  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1841  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0999  cobalamin synthase  33.46 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2452  cobalamin synthase  33.2 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639448  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  30.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2784  cobalamin synthase  34.52 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.17 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  38.36 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.28 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1131  cobalamin 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.996937  normal  0.381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.24 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0659  cobalamin synthase  35.77 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  29.22 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0939  cobalamin-5'-phosphate synthase  31.37 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.527982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1138  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.25 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2368  cobalamin synthase  32.1 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  32.29 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0858  cobalamin synthase  34.59 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2361  cobalamin synthase  32.27 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>