81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3367 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3362  hypothetical protein  65.09 
 
 		 574 aa  711    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00117978  normal  0.0179726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3363  hypothetical protein  60.29 
 
 		 565 aa  657    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000877827  hitchhiker  0.00789659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3364  hypothetical protein  86.96 
 
 		 551 aa  969    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00271389  normal  0.0159799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3367  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1133    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000828737  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1812  hypothetical protein  58.12 
 
 		 575 aa  623  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.149725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.67 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.5 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.7 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.21 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  32.12 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  31.21 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.83 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.83 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  23.99 
 
 		 572 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  23.79 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  32.79 
 
 		 469 aa  56.6  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  29.2 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  27.86 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  23.92 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.48 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  29.71 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.44 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  32.23 
 
 		 439 aa  53.9  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  27.74 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.87 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  24.76 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  27.74 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 461 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.37 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.84 
 
 		 430 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  27.94 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.04 
 
 		 1097 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  25.14 
 
 		 450 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.57 
 
 		 395 aa  50.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 461 aa  50.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  28.26 
 
 		 442 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.74 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  24.22 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.41 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  23.74 
 
 		 1167 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0400  WD40 domain-containing protein beta Propeller  32.77 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  22.01 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.64 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.01 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  27.01 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  24.64 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  27.01 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  22.57 
 
 		 717 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.53 
 
 		 678 aa  47  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  22.94 
 
 		 419 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  23.57 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  29.41 
 
 		 1062 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.66 
 
 		 1076 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  23.95 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  24.82 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  21.76 
 
 		 1005 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  25.15 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  24.82 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  23.24 
 
 		 615 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  28.45 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  25.89 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  25.89 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  22.63 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  24.41 
 
 		 354 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  29.28 
 
 		 1111 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0221  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  24.28 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  23.67 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  21.69 
 
 		 443 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  25.43 
 
 		 434 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  25.71 
 
 		 434 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  20.48 
 
 		 443 aa  43.9  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  25 
 
 		 438 aa  43.9  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  23.44 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.42 
 
 		 367 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  27.45 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>