More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1888 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1888  response regulator receiver protein  100 
 
 		 365 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0392  response regulator receiver  40.91 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.196838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2287  response regulator receiver domain-containing protein  50.48 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000712178  hitchhiker  0.00000369164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0895  response regulator receiver protein  36.42 
 
 		 250 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 121 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 121 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 		 121 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 121 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  43.86 
 
 		 121 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  39.47 
 
 		 121 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 121 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 121 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 1695 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 121 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 944 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1168 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0218  diguanylate cyclase  37.61 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  39.81 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 2099 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1131 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 1362 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  37.65 
 
 		 124 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 2099 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  28.17 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1142 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0918  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 1629 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1954 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.11 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  37.14 
 
 		 1200 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  36.79 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 944 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  34.26 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.36 
 
 		 1029 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  34.26 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.86 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1155 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1155 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2152  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.11 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0525986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  35.25 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1149 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1155 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.11 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1857 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  34.26 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  35.19 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  37.04 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1849  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.468098  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2788  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.31 
 
 		 715 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.941936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  37.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.27 
 
 		 435 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1896 aa  69.3  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1839 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1646 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1647 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 125 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  39.6 
 
 		 1361 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 869 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 916 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1646 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 146 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 161 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  30.05 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  36.79 
 
 		 123 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 132 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1216 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1588 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0518  CheA signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 2175 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 2022 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  41.98 
 
 		 603 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  34.78 
 
 		 1158 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  38.24 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 920 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 2423 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0692  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.93 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.370043  unclonable  0.00000000838432 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 770 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>