126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1047 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.87 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  23.43 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0586  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.86 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  24.63 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.75 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  22.96 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  25.47 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.31 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.31 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.74 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  24.11 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  21.81 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  19.91 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 		 1165 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.14 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  31.25 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01205  ABC-type amino acid transport/signal transduction system, periplasmic component/domain  20.85 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  27.57 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  24.28 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.03 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  23.21 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  23.21 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  23.21 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.82 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  21.52 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  27.17 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  25.45 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  24.43 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.69 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  23.96 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  22.68 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.57 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.44 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.38 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  24.05 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  22.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  23.02 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  23.66 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  23.6 
 
 		 727 aa  50.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  25.37 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  20.75 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  23.6 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0340  peptidoglycan-binding LysM  21.66 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  20.75 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.56 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1953  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.39 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450219  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3857  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  24.07 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  21.96 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3667  extracellular solute-binding protein family 3  25.22 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.200232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0300  extracellular solute-binding protein family 3  25.35 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000692776  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1879  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.81 
 
 		 281 aa  45.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0527  hypothetical protein  24.14 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.28 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  24.03 
 
 		 468 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0330  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.18 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.22 
 
 		 2213 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>