More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0300 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0300  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000692776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2578  extracellular solute-binding protein  50.7 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  29.55 
 
 		 578 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  28.64 
 
 		 578 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  27.93 
 
 		 575 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  28.75 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 620 aa  88.6  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  24.9 
 
 		 560 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  28.25 
 
 		 596 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  26.89 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  26.89 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  26.89 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  26.89 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  27.31 
 
 		 597 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  27.48 
 
 		 578 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 584 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  26.89 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  26.92 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  26.58 
 
 		 599 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.41 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  26.76 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.94 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  25.6 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.06 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 604 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.48 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  29.07 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 590 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.7 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.9 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.15 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.24 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.24 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.24 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.24 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 780 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.79 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.79 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  25.45 
 
 		 572 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  24.9 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.1 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  24.9 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.9 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.79 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  26.82 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.9 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.9 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  28.44 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  24.7 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>