52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0330 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0330  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  37.87 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26540  hypothetical protein  38.4 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.171066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2252  hypothetical protein  38.82 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  36.6 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4115  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1653  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.47 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3772  hypothetical protein  33.05 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3524  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4200  hypothetical protein  33.05 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15200  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2187  hypothetical protein  29 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1997  hypothetical protein  27.84 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  23.92 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0201  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  29.28 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  29.03 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  26.58 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  28.97 
 
 		 596 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  21.65 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  28.04 
 
 		 597 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  28.04 
 
 		 599 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 584 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24.03 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.87 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  22.55 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.51 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  23.28 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  27.27 
 
 		 598 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 		 1279 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 626 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1055 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 780 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  25.96 
 
 		 596 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.87 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 262 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>