59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0751 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  100 
 
 
158 aa  315  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  61.78 
 
 
159 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  61.78 
 
 
159 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  61.78 
 
 
159 aa  174  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  57.32 
 
 
159 aa  165  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  42.77 
 
 
161 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  42.68 
 
 
161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  38.61 
 
 
165 aa  125  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  35 
 
 
165 aa  124  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  35.85 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  35.58 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  37.34 
 
 
165 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  35.22 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  34.16 
 
 
170 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  38.79 
 
 
151 aa  100  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  33.13 
 
 
167 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  31.25 
 
 
159 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  31.68 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  30 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  33.74 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  32.93 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.52 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  30.3 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  39.81 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  30.37 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  31.62 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  28.31 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  29.63 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  32.34 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  30.77 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  34.62 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  29.92 
 
 
205 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  23.9 
 
 
194 aa  61.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  37.04 
 
 
580 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  42.65 
 
 
634 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  42.03 
 
 
633 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  46.55 
 
 
546 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  37.1 
 
 
626 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  27.59 
 
 
466 aa  47.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  43.55 
 
 
608 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  43.55 
 
 
585 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  28.43 
 
 
378 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  23.31 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  34.48 
 
 
566 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  25.33 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  36.21 
 
 
546 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  38.71 
 
 
600 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  38.71 
 
 
538 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1208  helicase c2  37.93 
 
 
541 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.852242  normal  0.0992609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10139  RNA binding protein Ligatin/Tma64, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12570)  31.4 
 
 
356 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00215023  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  38.71 
 
 
538 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  34.29 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  31.68 
 
 
365 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  36.49 
 
 
539 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  35.48 
 
 
615 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.99 
 
 
652 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  35.48 
 
 
538 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  40 
 
 
544 aa  40.8  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>