More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf003 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf003  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 365 aa  735    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.98 
 
 		 378 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.39 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  27.44 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  25.27 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.3 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  27.18 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  26.51 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.77 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  26.77 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  27.32 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  26.82 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  25.79 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  26.05 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.63 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.86 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  25.2 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.88 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.67 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000374529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0484  DNA polymerase III, beta subunit  21.62 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000936816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.32 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.32 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  26.04 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  25.83 
 
 		 397 aa  109  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  24.72 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.83 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.61 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  24.59 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0002  DNA polymerase III subunit beta  24.27 
 
 		 380 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.376275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0002  DNA polymerase III subunit beta  24.87 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  24.59 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.43 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1435  DNA polymerase III subunit beta  25.64 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.674698  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  22.99 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  23.66 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  22.64 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  23.99 
 
 		 382 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.72 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.29 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.79 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.78 
 
 		 370 aa  99.8  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.48 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  21.9 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.75 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0963  DNA polymerase III, beta subunit  26.91 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.245361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  23.71 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0815  DNA polymerase III, beta subunit  26.67 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  unclonable  0.000000015774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.64 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.46 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.35 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.57 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  26.86 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  24.71 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.45 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.01 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  23.7 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  25.71 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  21.75 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  22.83 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  23.47 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  26.06 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.7 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.36 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  22.57 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  22.87 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  22.87 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  25.48 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.08 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.94 
 
 		 374 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.57 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  23.18 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.54 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  24.01 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.4 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000849521  normal  0.168185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1087  DNA polymerase III, beta subunit  20.18 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000722327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00020  DNA polymerase III, beta subunit  25.53 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  22.25 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  23.36 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  25.15 
 
 		 372 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  25.15 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0044  DNA polymerase III, beta subunit  24.49 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  23.03 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  22.22 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  23.31 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  24.56 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  24.36 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl002  DNA polymerase III, beta chain  26.98 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  24.26 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>