218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02028 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02028  putative RND efflux system protein, MFP subunit  100 
 
 		 317 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.692018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2030  biotin/lipoyl attachment  46.25 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.359501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3767  Fis family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1956  hypothetical protein  41.67 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0111518  normal  0.309858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0386  hypothetical protein  37.73 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1958  putative RND efflux system protein, MFP subunit  35.16 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1969  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  37.23 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0226  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2096  secretion protein HlyD  34.51 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4385  secretion protein HlyD  36.08 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.3317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00373  HelB protein  32.53 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3996  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  34.66 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  33.59 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08530  efflux system component, RND family  30.89 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  29.79 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31030  putative cation efflux system protein  31.15 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000427913  unclonable  4.33311e-22 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  30.34 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3869  cobalt-zinc-cadmium resistance protein (cation efflux system protein)  30.53 
 
 		 432 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  30.96 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.57 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  30.55 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  29.81 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00306  Secretion protein HlyD  28.63 
 
 		 412 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0666  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  28.62 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.188115  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.6 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  30.58 
 
 		 330 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.58 
 
 		 457 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  31.05 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  29.38 
 
 		 489 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 489 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 457 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 488 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 489 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 491 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  30.11 
 
 		 491 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.79 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  29.26 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  30.48 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  30.48 
 
 		 516 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  29.95 
 
 		 489 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  29.95 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  29.95 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  29.95 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  29.95 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3370  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.948815  normal  0.259543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  29.38 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.6 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  27.14 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  27.14 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  24.47 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  25.91 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  25.71 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  25.79 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  24.23 
 
 		 502 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  23.78 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  24.75 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  24.29 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  24.26 
 
 		 484 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  23.27 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  24.47 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  30.73 
 
 		 418 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 416 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  22.75 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  25.13 
 
 		 416 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 		 416 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 		 416 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.32 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.89 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  31.41 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  30.37 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  24.24 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  25.26 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5136  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.89 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.26 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  27.08 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>