115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5765 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5765  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5991  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  87.29 
 
 
299 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1819  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  75.59 
 
 
299 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2155  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  75.25 
 
 
299 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1771  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  73.91 
 
 
299 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0518  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  74.92 
 
 
299 aa  454  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423522  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1802  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  61.87 
 
 
299 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354155  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0845  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  58.25 
 
 
299 aa  358  5e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3322  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  56.61 
 
 
299 aa  350  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3918  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  55.52 
 
 
303 aa  334  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1148  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  54.18 
 
 
299 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0451  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  54.03 
 
 
297 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2362  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  55.03 
 
 
296 aa  315  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01591  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  51.53 
 
 
294 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  52.1 
 
 
308 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.790294  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0692  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  50.5 
 
 
299 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  52.3 
 
 
300 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2030  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  50.81 
 
 
308 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1981  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  50.66 
 
 
307 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0793  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  51.97 
 
 
300 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.824687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0880  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  48.23 
 
 
311 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0387  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  49.84 
 
 
300 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366425  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3422  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  50.32 
 
 
307 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0078  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  46.58 
 
 
307 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6301  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  45.63 
 
 
309 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0861  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.03 
 
 
305 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  43.26 
 
 
310 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2585  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.03 
 
 
310 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0175933  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1966  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.21 
 
 
304 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0167068  normal  0.26132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2252  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.19 
 
 
305 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.544865  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4035  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.91 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476112  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6509  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.29 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62343  normal  0.0320725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  38.89 
 
 
304 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00766153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41670  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.07 
 
 
302 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0732  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.42 
 
 
305 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115489  normal  0.0583771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1779  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.11 
 
 
305 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38820  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.83 
 
 
304 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3308  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.83 
 
 
304 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4824  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.04 
 
 
303 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0245  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  43.04 
 
 
304 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3056  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.1 
 
 
307 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2095  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.2 
 
 
305 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2489  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.2 
 
 
305 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.58 
 
 
307 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0289  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  37.5 
 
 
311 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.625234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  38.76 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0404  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.74 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295796  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0379  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.74 
 
 
303 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0512  coenzyme PQQ synthesis protein B  39.09 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4671  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.09 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2453  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.86 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.743561  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.26 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.26 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1765  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1699  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.35 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.459515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2620  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.09 
 
 
309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0408  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.74 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2467  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.97 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.02 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824566  normal  0.0122877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1683  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  37.94 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6165  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.84 
 
 
307 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494701  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5898  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.84 
 
 
307 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2174  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  37.58 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  28.7 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0898  coenzyme PQQ synthesis protein B  22.62 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 
492 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  27.65 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1711  coenzyme PQQ synthesis protein B  25.31 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.290303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
239 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  29.94 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  28.25 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  35.29 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000635041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
270 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  28.77 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  30.93 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  22.42 
 
 
252 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1284  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
253 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  24.22 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3063  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
254 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00796605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0316  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
240 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  35.64 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  23.7 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  27.88 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 
254 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
242 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
257 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3413  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  23.66 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0143  Beta-lactamase-like  30.7 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  25.32 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 
251 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>