95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6509 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6509  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62343  normal  0.0320725 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2467  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  77.45 
 
 		 306 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4035  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  66.45 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476112  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0732  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  65.56 
 
 		 305 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115489  normal  0.0583771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2489  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  64.47 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1779  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  62.83 
 
 		 305 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398534  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2095  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  63.16 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0289  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  58.52 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.625234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  55.96 
 
 		 304 aa  359  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00766153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1966  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  60.4 
 
 		 304 aa  358  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0167068  normal  0.26132 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  62.58 
 
 		 307 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824566  normal  0.0122877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0245  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  58.17 
 
 		 304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1683  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57.43 
 
 		 305 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5898  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  60.26 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  61.49 
 
 		 307 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6165  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  59.94 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57.76 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  60.84 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  60.84 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3056  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4824  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57.33 
 
 		 303 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0408  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57.33 
 
 		 303 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3308  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  58.31 
 
 		 304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0512  coenzyme PQQ synthesis protein B  56.68 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0404  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57 
 
 		 303 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0379  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  56.68 
 
 		 303 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38820  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  58.31 
 
 		 304 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41670  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  57 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4671  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  56.35 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1699  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  56.21 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.459515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2620  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  53.75 
 
 		 309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6247  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  53.67 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2585  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  53.9 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0175933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2252  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  48.68 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.544865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0861  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  44.59 
 
 		 305 aa  261  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2453  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  42.63 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.743561  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3322  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  44.12 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1802  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.42 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354155  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5765  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.29 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1981  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  43.97 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0845  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.19 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1148  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  39.38 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1771  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.42 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1819  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.45 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2155  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.45 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0078  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  41.61 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3918  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.35 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5991  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.68 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0518  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.16 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.91 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0793  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  40.58 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.824687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0451  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.02 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0692  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.81 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0387  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.74 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01591  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.74 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2362  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.02 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0880  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  38.02 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3422  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  39.12 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2030  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  37.34 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6301  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  36.45 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  38.29 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.790294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2174  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  35.95 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1792  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  31.41 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000635041 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1173  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0898  coenzyme PQQ synthesis protein B  22.15 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1711  coenzyme PQQ synthesis protein B  23.49 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.290303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11000  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00714887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2057  beta-lactamase domain-containing protein  24.67 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  27.05 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2465  metallo-beta-lactamase family protein  32.06 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  32.28 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0205  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0765  Beta-lactamase-like  33.66 
 
 		 264 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3277  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  24.66 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0135  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  22.63 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2787  metal-dependent hydrolase  24.4 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  30.69 
 
 		 492 aa  46.6  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0553  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4916  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1261  beta-lactamase-like protein  24.37 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.181589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0314  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1876  beta-lactamase domain protein  23.28 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  31.96 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  30.15 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  25.33 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0332  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2878  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  23.01 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2213  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>