91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1711 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1711  coenzyme PQQ synthesis protein B  100 
 
 
320 aa  657    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.290303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0898  coenzyme PQQ synthesis protein B  51.72 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1148  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  25.47 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2362  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.44 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3322  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  26.63 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1771  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.79 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2155  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.79 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1819  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.79 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01591  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.72 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0880  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.53 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0793  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.76 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.824687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0692  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.94 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1981  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.83 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.44 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0422366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0732  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.87 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115489  normal  0.0583771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2489  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.39 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5765  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.31 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.410014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1779  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  27.37 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398534  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
261 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5991  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.17 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3918  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.3 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0518  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.03 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423522  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4035  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.54 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476112  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0451  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.75 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.97 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00766153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2095  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.82 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.283708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3422  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.69 
 
 
307 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.492214  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0078  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.17 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0861  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.22 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2467  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.2 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0245  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.84 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109677 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3246  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.58 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6301  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.62 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2620  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.92 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5122  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.58 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1765  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1802  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.38 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354155  normal  0.923595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0387  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.81 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366425  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2630  beta-lactamase-like  26.94 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521897  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1683  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.2 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2252  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.05 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.544865  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3056  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.46 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.09 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.790294  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6509  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.49 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62343  normal  0.0320725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2030  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.72 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6165  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.44 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.494701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0404  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.45 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295796  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2453  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.9 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.743561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5159  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.27 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0408  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.55 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5898  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.68 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4824  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.84 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5158  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.46 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0289  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.61 
 
 
311 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.625234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  25.31 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824566  normal  0.0122877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2174  coenzyme PQQ biosynthesis protein B  24.92 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0379  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.97 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1966  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.15 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0167068  normal  0.26132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4671  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.3 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  25.93 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  25.93 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0488  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 
254 aa  49.3  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.932747  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1699  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  23.05 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.459515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3308  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.97 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3330  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2010  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1016  hypothetical protein  25.82 
 
 
239 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38820  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  26.69 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41670  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  24.05 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.73 
 
 
318 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2719  putative hydrolase  26.53 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0507266  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0485  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 
240 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300873  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  29.8 
 
 
321 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0528  ATP-binding protein PhnP  25.47 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0676  PhnP-like protein  27.23 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0845  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqB  22.73 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2147  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2330  PhnP-like protein  27.23 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.500719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2088  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5044  ribonuclease Z  30.26 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2337  beta-lactamase-like  27.96 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1954  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0189  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6466  beta-lactamase-like protein  34.34 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408114  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0031  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.208776  normal  0.175633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2707  putative hydrolase  27.67 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0985  metallo-beta-lactamase family protein  23.64 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 
551 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0921  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  27.92 
 
 
315 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1274  beta-lactamase-like  27.4 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31947  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  28.95 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>