More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5537 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  100 
 
 
450 aa  892    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0978  major facilitator superfamily MFS_1  67.46 
 
 
447 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4289  major facilitator superfamily transporter  51.98 
 
 
437 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467204  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4601  major facilitator transporter  51.98 
 
 
437 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4223  major facilitator transporter  51.98 
 
 
437 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1701  major facilitator transporter  39.66 
 
 
456 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3191  major facilitator transporter  41.27 
 
 
442 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4034  major facilitator transporter  41.27 
 
 
442 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.543107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4332  major facilitator transporter  41.27 
 
 
442 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2830  major facilitator family transporter  42.75 
 
 
450 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4257  major facilitator transporter  40.63 
 
 
444 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139885  normal  0.0686355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2952  major facilitator transporter  42.53 
 
 
433 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326593  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2859  major facilitator transporter  41.5 
 
 
433 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4278  major facilitator transporter  39.23 
 
 
442 aa  279  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.465372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4222  major facilitator transporter  39.85 
 
 
442 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130857  normal  0.414624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
445 aa  272  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3748  major facilitator transporter  38.94 
 
 
442 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355731  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  38.46 
 
 
436 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6622  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
439 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4767  major facilitator transporter  36.55 
 
 
450 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4758  major facilitator family transporter  36.88 
 
 
455 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0040398  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0662  major facilitator transporter  35.6 
 
 
450 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4632  major facilitator transporter  36.66 
 
 
450 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440044  hitchhiker  0.00103445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  36.58 
 
 
433 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2336  membrane protein  40.95 
 
 
445 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1121  major facilitator family transporter  40.81 
 
 
445 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1035  major facilitator family transporter  40.95 
 
 
445 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0604  membrane protein  40.7 
 
 
445 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1274  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0863  membrane protein  40.7 
 
 
445 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1830  major facilitator family transporter  40.7 
 
 
445 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 
434 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
440 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.44 
 
 
442 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  36.32 
 
 
432 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  38.88 
 
 
439 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  33.94 
 
 
459 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  36.07 
 
 
435 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  35.17 
 
 
448 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  35.17 
 
 
448 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0290  major facilitator transporter  40.78 
 
 
437 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  35.17 
 
 
448 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  38.11 
 
 
428 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  34.22 
 
 
447 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.27 
 
 
439 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  35.23 
 
 
433 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  34.92 
 
 
443 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
439 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  35.86 
 
 
437 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 
443 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  35.6 
 
 
437 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  36.83 
 
 
436 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  36.83 
 
 
436 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  36.83 
 
 
436 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  34.15 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  37.41 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  34.4 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  38.66 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  36.01 
 
 
440 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  35.45 
 
 
432 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  36.48 
 
 
436 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  35.88 
 
 
437 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3469  major facilitator transporter  38.9 
 
 
443 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.129965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  38.14 
 
 
442 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  34.77 
 
 
435 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
430 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  37.12 
 
 
464 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  36.03 
 
 
437 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  37.73 
 
 
436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0732  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104598  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36080  putative MFS transporter  35.61 
 
 
440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3720  major facilitator transporter  36.47 
 
 
448 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
444 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_003296  RS02128  putative transport transmembrane protein  36.8 
 
 
433 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  36.71 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  36.71 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  36.71 
 
 
434 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  36.53 
 
 
434 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  36.47 
 
 
434 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
444 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  36.07 
 
 
434 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
443 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3075  MFS family transporter  35.6 
 
 
440 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.093218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  34.89 
 
 
440 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  36.07 
 
 
434 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6283  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 
442 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  36.57 
 
 
436 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  35.4 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3284  major facilitator transporter  38.9 
 
 
455 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3284  major facilitator family transporter  35.94 
 
 
441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  36.85 
 
 
441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1619  major facilitator transporter  35.88 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  37.16 
 
 
433 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  37.91 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  36.23 
 
 
447 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1206  major facilitator transporter  36.92 
 
 
442 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  33.03 
 
 
443 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2400  major facilitator transporter  35.1 
 
 
429 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>