More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3733 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  100 
 
 
293 aa  567  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  67.72 
 
 
301 aa  358  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  65.42 
 
 
302 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  67.72 
 
 
299 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  64.77 
 
 
309 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  57.25 
 
 
301 aa  291  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  55.9 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  53.74 
 
 
295 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 
296 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 
327 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 
310 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  52.74 
 
 
384 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  53.55 
 
 
304 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  53.1 
 
 
330 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 
338 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  54.33 
 
 
322 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
303 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  45.52 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  43.43 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 
288 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  47.92 
 
 
288 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 
290 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  33.45 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.66 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.66 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.62 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.07 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.68 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.93 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  32.75 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  31.58 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.59 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  30.18 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  37.14 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  36.19 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  36.19 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.86 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.24 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2029  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  30.47 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 
453 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3497  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>