More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3497 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3497  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
335 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7224  alpha/beta hydrolase fold protein  55 
 
 
341 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  30.51 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  29.35 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  42.14 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  28.99 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  43.22 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  27.83 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  28.13 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  35.09 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.9 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  29.58 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  35.83 
 
 
271 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.95 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
275 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.44 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
309 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  26.79 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  29.47 
 
 
295 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
273 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
303 aa  62.8  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.66 
 
 
301 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
287 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
278 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.41 
 
 
443 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  33.56 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  41.05 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  19.92 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  41.05 
 
 
274 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  30.98 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  26.98 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.19 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
311 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.11 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.11 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
265 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.11 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
291 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  34.11 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>