More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3514 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3514  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.996987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0525  hypothetical protein  53.66 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2223  hypothetical protein  54.41 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.100096  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1175  hypothetical protein  53.69 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4861  hypothetical protein  48.79 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  47.57 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  45.96 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  45.96 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4020  hypothetical protein  48.29 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  40.59 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  44.83 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0170  hypothetical protein  43.15 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  43.15 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0184  hypothetical protein  45.63 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1842  hypothetical protein  43.63 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310019  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  43.27 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  40.72 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0760  hypothetical protein  38.86 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  40.62 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  47.13 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  38.86 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  39.58 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  39.58 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4184  hypothetical protein  43.41 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.655016 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3856  hypothetical protein  43.41 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  42.05 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  39.38 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  42.05 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  40.41 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  38.42 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3918  hypothetical protein  43.37 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  39.38 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  39.53 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  38.34 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  39.2 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  38.38 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  35.57 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  39.2 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  38.07 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  41.54 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.88 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  36.98 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  37.88 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  35.23 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  40.1 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2574  hypothetical protein  37.8 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  hitchhiker  0.000000675229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  38.19 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  34.9 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  36.87 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  38.75 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  36.36 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6354  protein of unknown function UPF0126  39.38 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  34.91 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  35.08 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  33 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  35.76 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  33.86 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0254  hypothetical protein  36.46 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0652374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  39.49 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0761  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0767  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0781  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  36.98 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  37.07 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  38.95 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  31.03 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.59 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  33.68 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  34.59 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  33.5 
 
 		 200 aa  95.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  40.2 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  38.69 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  39.64 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  34.05 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  34.05 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  32.97 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1115  membrane protein  37.31 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0456  protein of unknown function UPF0126  36.41 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  35.67 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3716  hypothetical protein  39.2 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  32.49 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  35.45 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  32.46 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  31.96 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  41.95 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2915  hypothetical protein  43.11 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0019192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>