77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1387 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 307 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  84.69 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  66.01 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  64.29 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  63.96 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  64.29 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  46.21 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  38.61 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  40.57 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  41.49 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  40.99 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.54 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 701 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  25.97 
 
 		 576 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.29 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  22.15 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 650 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  32.12 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  34.33 
 
 		 701 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  25.89 
 
 		 658 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 663 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 692 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 690 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 611 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 691 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 690 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.07 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  32.54 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 681 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.3 
 
 		 599 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.84 
 
 		 572 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 572 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  29.79 
 
 		 601 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.81 
 
 		 564 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  29.35 
 
 		 503 aa  53.1  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 587 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.58 
 
 		 530 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  31.25 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 657 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 693 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 680 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  29.13 
 
 		 335 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  25 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 664 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  34.18 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  34.18 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  34.18 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 338 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  30.27 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  29.61 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  31.02 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  28.16 
 
 		 667 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 533 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  32.91 
 
 		 577 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  26.64 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.45 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  31.62 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  25.83 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  34.19 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>