297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1639 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  34.93 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  37.59 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
139 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
583 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  39.06 
 
 
577 aa  74.3  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
303 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  28.15 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
341 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  37.63 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  37.63 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  27.91 
 
 
336 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  37.63 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  37.63 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  40.96 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  28 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  40.96 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  40.96 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  40.96 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  40.96 
 
 
229 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  29.69 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  30 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  34.92 
 
 
424 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 
305 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  26.52 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
356 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.08 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
326 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
333 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  28.91 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  28.91 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
536 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
219 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  28.91 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  29.46 
 
 
150 aa  52  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  30.37 
 
 
129 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
182 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
144 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  39.24 
 
 
156 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
303 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  29.91 
 
 
292 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
282 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
268 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2744  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 
324 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  30 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  26.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  30.34 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  31.82 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  27.78 
 
 
383 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  28.7 
 
 
248 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  31.82 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.34 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 
322 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  28.72 
 
 
314 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  25.53 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>