More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0994 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  100 
 
 		 359 aa  745    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1006  site-specific tyrosine recombinase XerS  72 
 
 		 356 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000475631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1302  site-specific tyrosine recombinase XerS  44.26 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.287333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0978  site-specific tyrosine recombinase XerS  44.66 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1013  site-specific tyrosine recombinase XerS  45.33 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00257725  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5530  site-specific tyrosine recombinase XerS  37.18 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267916  hitchhiker  0.00142122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  36.6 
 
 		 358 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  33.06 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5532  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.97 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644958 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0200  site-specific tyrosine recombinase XerS  33.33 
 
 		 361 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  9.249629999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0261  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.69 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0311  site-specific tyrosine recombinase XerS  32.69 
 
 		 361 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0151  site-specific tyrosine recombinase XerS  30.85 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  32.33 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  25.14 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.76 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.1 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.37 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.31 
 
 		 330 aa  92.4  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  29.5 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  34.55 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 296 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.9 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  25.92 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  24.6 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.06 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25.88 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  35.76 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  35.76 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.9 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  26.59 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  32.16 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30.99 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  30.92 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  34.34 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  34.21 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.85 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  33.77 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  25.61 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.09 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  32.1 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  24.85 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  32.68 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  26.89 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  25.95 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  23.58 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  32.89 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  32.28 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  32.89 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.89 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.18 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  25.24 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  25.15 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.95 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  24.78 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  33.33 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.24 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  31.61 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.61 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  29.2 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  37.66 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  29.2 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>