69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1320 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0242  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  91.81 
 
 		 526 aa  959    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.703018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1320  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  100 
 
 		 516 aa  1051    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.010689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1621  hypothetical protein  98.06 
 
 		 516 aa  1030    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1643  Type IV secretory pathway VirD2 pilin (relaxase)-like protein  33.86 
 
 		 493 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1821  hypothetical protein  33.14 
 
 		 661 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  32.7 
 
 		 703 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  30.6 
 
 		 667 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  35 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  32.43 
 
 		 657 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  33.13 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  34.35 
 
 		 583 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  32.78 
 
 		 683 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  31.25 
 
 		 786 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  32.74 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 655 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  33.06 
 
 		 678 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  31.6 
 
 		 657 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  31.82 
 
 		 793 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  33.7 
 
 		 657 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  31.54 
 
 		 700 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  32.96 
 
 		 660 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 581 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  30.7 
 
 		 661 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3351  hypothetical protein  34.01 
 
 		 583 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182876  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  32.15 
 
 		 701 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  31.96 
 
 		 658 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  31.68 
 
 		 662 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  33.73 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  30.38 
 
 		 661 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  31.92 
 
 		 653 aa  150  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  33.13 
 
 		 584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  32.31 
 
 		 665 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  32.72 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  30.35 
 
 		 654 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  32.26 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  29.19 
 
 		 662 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  31.8 
 
 		 579 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  30.57 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  30.84 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  30.61 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  31.15 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1601  hypothetical protein  30.66 
 
 		 579 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7738  hypothetical protein  32.04 
 
 		 585 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  33.85 
 
 		 578 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  27.8 
 
 		 579 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  30.43 
 
 		 625 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  30.33 
 
 		 579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  30.09 
 
 		 579 aa  133  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1507  hypothetical protein  30.51 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  31.38 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  31.68 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0588  hypothetical protein  31.23 
 
 		 579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  31.91 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0685  hypothetical protein  30.67 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.30597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3007  hypothetical protein  28.46 
 
 		 707 aa  130  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  28.31 
 
 		 579 aa  130  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  28.31 
 
 		 579 aa  130  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1067  hypothetical protein  30.7 
 
 		 703 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  31.88 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3553  hypothetical protein  30.67 
 
 		 683 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  29.52 
 
 		 694 aa  128  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  31.5 
 
 		 573 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2343  hypothetical protein  28.24 
 
 		 640 aa  123  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0632  hypothetical protein  30.48 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  32.47 
 
 		 597 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2330  hypothetical protein  29.27 
 
 		 683 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0854  hypothetical protein  32.64 
 
 		 262 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1329  hypothetical protein  93.62 
 
 		 47 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0250532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1628  hypothetical protein  93.48 
 
 		 46 aa  87  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.432265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>