More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3505 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  100 
 
 		 831 aa  1648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  56.68 
 
 		 364 aa  350  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  55.52 
 
 		 341 aa  337  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  56.88 
 
 		 368 aa  328  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  56.6 
 
 		 334 aa  320  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  53.53 
 
 		 358 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  51.3 
 
 		 338 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  50 
 
 		 353 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  51.38 
 
 		 371 aa  294  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  45.32 
 
 		 357 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  50.55 
 
 		 349 aa  280  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  53.47 
 
 		 414 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  47.77 
 
 		 422 aa  269  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  47.33 
 
 		 346 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  48.96 
 
 		 389 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  44.34 
 
 		 532 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  47.6 
 
 		 341 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  40.13 
 
 		 393 aa  232  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  42.86 
 
 		 390 aa  230  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  37.35 
 
 		 385 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  36.34 
 
 		 387 aa  226  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  42.55 
 
 		 392 aa  225  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.22 
 
 		 536 aa  224  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  41.69 
 
 		 427 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.07 
 
 		 395 aa  217  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  42.86 
 
 		 308 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.98 
 
 		 395 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.29 
 
 		 372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.29 
 
 		 372 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  40.61 
 
 		 271 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.17 
 
 		 562 aa  213  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  39.34 
 
 		 540 aa  213  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.38 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.38 
 
 		 580 aa  211  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 562 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  42.12 
 
 		 563 aa  208  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  42.53 
 
 		 284 aa  208  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  44 
 
 		 439 aa  207  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.91 
 
 		 568 aa  206  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  40.49 
 
 		 563 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.6 
 
 		 532 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.85 
 
 		 564 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 		 536 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  41.26 
 
 		 549 aa  197  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.93 
 
 		 589 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.36 
 
 		 536 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  37.98 
 
 		 291 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.7 
 
 		 558 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  38.04 
 
 		 291 aa  194  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  39.55 
 
 		 584 aa  191  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.45 
 
 		 562 aa  191  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.93 
 
 		 538 aa  190  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  40.23 
 
 		 563 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 613 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.93 
 
 		 572 aa  188  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 541 aa  187  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  39.23 
 
 		 354 aa  187  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  42.32 
 
 		 381 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 587 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  39.37 
 
 		 303 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  40.77 
 
 		 281 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.93 
 
 		 562 aa  179  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  38.6 
 
 		 267 aa  177  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  38.29 
 
 		 266 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  37.08 
 
 		 266 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.08 
 
 		 557 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  35.52 
 
 		 388 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 557 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 559 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 557 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  38.29 
 
 		 266 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.41 
 
 		 562 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.77 
 
 		 562 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.41 
 
 		 554 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  38.75 
 
 		 267 aa  173  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  38.55 
 
 		 519 aa  173  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  35.27 
 
 		 302 aa  173  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  35.14 
 
 		 388 aa  173  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.77 
 
 		 541 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  37.7 
 
 		 498 aa  172  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 557 aa  171  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  35.42 
 
 		 459 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.28 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  35.42 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.83 
 
 		 422 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  37.22 
 
 		 300 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  37.26 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  41.79 
 
 		 570 aa  164  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  40.31 
 
 		 300 aa  164  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  41.77 
 
 		 274 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  41.77 
 
 		 274 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  34.84 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  37.5 
 
 		 281 aa  160  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  41.37 
 
 		 274 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  38.25 
 
 		 304 aa  160  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  37.16 
 
 		 302 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  37.16 
 
 		 302 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  37.16 
 
 		 302 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  33.85 
 
 		 505 aa  160  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>