96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1559 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1559  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000751375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.63 
 
 		 257 aa  207  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  48.37 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.92 
 
 		 281 aa  147  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2032  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.56 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20540  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  38.59 
 
 		 255 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125919  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.32 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  40.62 
 
 		 127 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3346  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.03 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  35.11 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  31.41 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  24.57 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  24.86 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.76 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  30.69 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.41 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.96 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 		 110 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.68 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  23.86 
 
 		 259 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.89 
 
 		 127 aa  52.4  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 109 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  27.47 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  25.41 
 
 		 275 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  28.4 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  29.1 
 
 		 387 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.72 
 
 		 244 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 		 403 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  26.51 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 		 260 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  23.39 
 
 		 256 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.76 
 
 		 233 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5179  carboxymuconolactone decarboxylase  25.83 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351451  normal  0.0612334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.51 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.84 
 
 		 398 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  30.59 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.93 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  28.93 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.52 
 
 		 428 aa  45.1  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 132 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2236  carboxymuconolactone decarboxylase  25.86 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  24.58 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 		 396 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.51 
 
 		 105 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.98 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  22.5 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 393 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  22.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  22.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 393 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 393 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 393 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  26.92 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 393 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.81 
 
 		 393 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  22.69 
 
 		 124 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.441447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>