88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1350 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 418 aa  830    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  42.44 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  39.18 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  30.26 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  30.26 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  30.02 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  30.02 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  29.79 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  29.79 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  29.95 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1676 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  23.45 
 
 		 905 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 938 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 750 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  24.24 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 		 2262 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  20.47 
 
 		 968 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.43 
 
 		 733 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.6 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 		 624 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  27.61 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 3145 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  20.99 
 
 		 1112 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.46 
 
 		 1154 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.99 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.11 
 
 		 837 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  19.61 
 
 		 955 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  23.27 
 
 		 535 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 607 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1297 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 221 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  26.99 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.88 
 
 		 992 aa  46.6  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 2262 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1162 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.37 
 
 		 1162 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00910  chaperone, putative  35.8 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.38 
 
 		 725 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0106  tetratricopeptide repeat domain protein  29.02 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  31.58 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  25.88 
 
 		 1014 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 		 1402 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 2240 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.03 
 
 		 935 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 878 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 750 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 597 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 573 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1313 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 927 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.24 
 
 		 587 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 3936 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1261 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 955 aa  43.5  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.75 
 
 		 810 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1521  hypothetical protein  25 
 
 		 172 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 522 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15331  hypothetical protein  27.17 
 
 		 557 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  25.22 
 
 		 731 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  22.16 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.72 
 
 		 725 aa  42.7  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>