153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  59.18 
 
 		 232 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  40.14 
 
 		 241 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.44 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.71 
 
 		 260 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2361  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  44.57 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.0484328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2054  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 258 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0485994  normal  0.848173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2539  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.97 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.93 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7333  transcriptional regulator protein-like protein  41.03 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.14 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  33.91 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.91 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.17 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.21 
 
 		 230 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.14 
 
 		 318 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  37.23 
 
 		 344 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  43.86 
 
 		 164 aa  57  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.82 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  34.62 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.83 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  34.62 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  34.62 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3216  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.78 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  28 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.35 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 304 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  32.38 
 
 		 368 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  40.74 
 
 		 321 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.11 
 
 		 315 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.07 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  36.05 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  34.78 
 
 		 336 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 		 327 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 318 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.11 
 
 		 313 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  29.92 
 
 		 237 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  44.23 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.66 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  30 
 
 		 321 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30 
 
 		 336 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.82 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 335 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  28.57 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  28.57 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.5 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.56 
 
 		 327 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  27.48 
 
 		 252 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  38.1 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.83 
 
 		 323 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  34.72 
 
 		 326 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  27.34 
 
 		 326 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  28 
 
 		 330 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  33.08 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.81 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.37 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 334 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  29.89 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  38.46 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  42.31 
 
 		 350 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.23 
 
 		 321 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.82 
 
 		 322 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  34.09 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  33.71 
 
 		 343 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  31.96 
 
 		 326 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.03 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 334 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 675 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  44.44 
 
 		 351 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  26.32 
 
 		 512 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  48.28 
 
 		 313 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.19 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.93 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  32.88 
 
 		 331 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  30.36 
 
 		 334 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  39.29 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  28.45 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 309 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4540  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.36 
 
 		 228 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 238 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  29.51 
 
 		 238 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.61 
 
 		 315 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  28.44 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  40.62 
 
 		 321 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.41 
 
 		 322 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  36.73 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  46.51 
 
 		 336 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>