140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7333 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7333  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 168 aa  343  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2539  transcriptional regulator protein-like protein  71.81 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  59.31 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.99 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  41.03 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.59 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.58 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.5 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.62 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.75 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 683 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  37.5 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  37.5 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.3 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  27.52 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.73 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  45.31 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.77 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.08 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.45 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.18 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  27.45 
 
 		 320 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  27.45 
 
 		 320 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  45.45 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.45 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40 
 
 		 318 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2054  transcriptional regulator protein-like protein  35.29 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0485994  normal  0.848173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2361  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  43.55 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.0484328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 675 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  35.25 
 
 		 319 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.03 
 
 		 230 aa  52.4  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  33.78 
 
 		 241 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  25.95 
 
 		 314 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  27.45 
 
 		 320 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.75 
 
 		 319 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  27.45 
 
 		 320 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  27.86 
 
 		 339 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 		 234 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.47 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  36.99 
 
 		 334 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  41.18 
 
 		 323 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  33.02 
 
 		 237 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.7 
 
 		 232 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.7 
 
 		 232 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.7 
 
 		 232 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35 
 
 		 233 aa  47.8  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  38.36 
 
 		 334 aa  47.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  28.04 
 
 		 320 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  35 
 
 		 233 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  38.96 
 
 		 326 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  28.77 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.01 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.61 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0588  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.67 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.7 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  30.71 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 334 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  32.1 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.2 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  38.96 
 
 		 676 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 322 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  48.72 
 
 		 321 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  37.08 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  37.31 
 
 		 663 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.72 
 
 		 336 aa  45.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.7 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.25 
 
 		 229 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 		 339 aa  44.7  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0532  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.79 
 
 		 231 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 234 aa  44.3  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  29.87 
 
 		 229 aa  44.3  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  40.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  30.15 
 
 		 238 aa  44.3  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.53 
 
 		 302 aa  44.3  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  33.33 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  30.59 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  39.22 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  29.63 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.33 
 
 		 315 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  34.43 
 
 		 318 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2436  hypothetical protein  33.66 
 
 		 606 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 687 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.08 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.08 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  30.71 
 
 		 321 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  30.43 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>