217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2539 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2539  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 163 aa  319  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7333  transcriptional regulator protein-like protein  71.81 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  62.07 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.99 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  38.32 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  53.12 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  53.12 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  53.12 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  50 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.35 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.94 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.58 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.31 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2361  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  46.38 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.0484328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  35 
 
 		 369 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  39.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  39.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  39.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.86 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.75 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 683 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.03 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.78 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.65 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  43.33 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.06 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  32.41 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  33.7 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.73 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  31.71 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  52.63 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.37 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  38.1 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  31.54 
 
 		 321 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.51 
 
 		 317 aa  53.9  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  33.77 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  41.07 
 
 		 316 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0532  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  40.62 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  40.35 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0970  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.88 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  43.08 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0588  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.52 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 334 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 675 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  34.29 
 
 		 326 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.33 
 
 		 232 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.57 
 
 		 232 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.78 
 
 		 319 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  31.2 
 
 		 336 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  36.84 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  36.84 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  24.39 
 
 		 304 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  36.84 
 
 		 326 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  28.03 
 
 		 314 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  38.67 
 
 		 319 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  31.65 
 
 		 230 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  36.23 
 
 		 252 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.6 
 
 		 239 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  38.67 
 
 		 326 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 335 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.62 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4540  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.47 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.33 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.06 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  30.61 
 
 		 326 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.74 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  38.33 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.74 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.38 
 
 		 302 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  39.22 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.67 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.43 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.67 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.71 
 
 		 319 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.33 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.67 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  37.18 
 
 		 323 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  35.37 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2026  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.06 
 
 		 245 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826373  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0146  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.62 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.48 
 
 		 229 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0848  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.41 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2449  helix-turn-helix, type 11  29.01 
 
 		 229 aa  48.5  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.153287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.48 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.17 
 
 		 298 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 334 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.12 
 
 		 320 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.46 
 
 		 320 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.38 
 
 		 309 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7104  hypothetical protein  39.06 
 
 		 232 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>