197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  40.23 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  38.15 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  36.53 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  35.6 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  38.93 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.8 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  38.68 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.53 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  38.15 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  35.89 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  36.18 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  33.33 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  38.43 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.17 
 
 		 443 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.17 
 
 		 443 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.17 
 
 		 443 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  33.82 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  31 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  33.86 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.51 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  31.73 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  34.71 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  36.61 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.64 
 
 		 445 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 		 449 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.64 
 
 		 445 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  35.08 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.07 
 
 		 446 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  30.08 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  32.35 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  32.08 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  24.26 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  26.04 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  26.29 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.61 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.86 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.21 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.23 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.13 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  24.85 
 
 		 179 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  28.03 
 
 		 177 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.52 
 
 		 179 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.7 
 
 		 180 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.27 
 
 		 177 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.75 
 
 		 177 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.62 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.74 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.82 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  35.14 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  26.21 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.21 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  28.23 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.62 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.12 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.92 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.84 
 
 		 182 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  27.39 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.12 
 
 		 186 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.11 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.62 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.33 
 
 		 180 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.49 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.49 
 
 		 186 aa  49.7  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.38 
 
 		 178 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 186 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 		 180 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 		 180 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.86 
 
 		 181 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.3 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  21.82 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.53 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.43 
 
 		 177 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  25.3 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  22.93 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.92 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.93 
 
 		 180 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.87 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  30.28 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.92 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>