More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4298 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 626 aa  1200    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  49.52 
 
 		 624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  49.84 
 
 		 624 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  49.28 
 
 		 621 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  49.11 
 
 		 624 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  47.7 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  42.69 
 
 		 537 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  38.64 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  43.52 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  43.52 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  43.13 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 		 829 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  39.12 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 		 531 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  46.86 
 
 		 527 aa  253  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  41.18 
 
 		 488 aa  243  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  36.61 
 
 		 566 aa  243  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  37.94 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  38 
 
 		 552 aa  233  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  32.74 
 
 		 525 aa  224  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.58 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  28.54 
 
 		 533 aa  217  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.86 
 
 		 524 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  34.15 
 
 		 528 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  36.67 
 
 		 534 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 		 538 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  34.23 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.78 
 
 		 524 aa  210  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  35.04 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  42.57 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 		 564 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  33.63 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  35 
 
 		 526 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  38.97 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 532 aa  203  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  34.24 
 
 		 526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  44.9 
 
 		 581 aa  198  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  35.29 
 
 		 527 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  35.55 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  34.54 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  34.54 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 		 527 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 527 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.12 
 
 		 535 aa  197  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 537 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 526 aa  197  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  38.46 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  34.14 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 524 aa  194  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.86 
 
 		 425 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  37.11 
 
 		 535 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  29.71 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 		 526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.71 
 
 		 524 aa  183  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 560 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 560 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 		 560 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.91 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  44.91 
 
 		 601 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 526 aa  180  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 526 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  37.62 
 
 		 535 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 526 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  37.62 
 
 		 535 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 526 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  34.63 
 
 		 526 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  27.31 
 
 		 527 aa  177  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 		 525 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  36.44 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 525 aa  173  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  33.19 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  36.66 
 
 		 525 aa  173  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  39.59 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2436  sodium/hydrogen exchanger  35.25 
 
 		 495 aa  170  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0140335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3304  Na+/H+ antiporter  31.59 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 		 533 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 		 550 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2583  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 568 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  28.85 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  34.44 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 519 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>