More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1575 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  100 
 
 
346 aa  730    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  53.25 
 
 
340 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  38.48 
 
 
355 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  36.02 
 
 
350 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  37.69 
 
 
347 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.52 
 
 
361 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  35.9 
 
 
377 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  36.31 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.53 
 
 
353 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2826  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.87 
 
 
424 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0328786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  36.98 
 
 
336 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  35.69 
 
 
347 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.19 
 
 
341 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  34.78 
 
 
350 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  35.4 
 
 
352 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  34.64 
 
 
369 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  33.43 
 
 
347 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
352 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  33.43 
 
 
351 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  33.81 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  33.91 
 
 
342 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  32.01 
 
 
359 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.04 
 
 
354 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
359 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
347 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  31.44 
 
 
373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  32.01 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.01 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
343 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  31.16 
 
 
373 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  33.04 
 
 
363 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  33.52 
 
 
354 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
355 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  32.84 
 
 
362 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.62 
 
 
345 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.41 
 
 
358 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.92 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.92 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.28 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.64 
 
 
355 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  33.24 
 
 
354 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  32.56 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
342 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  31.76 
 
 
358 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.27 
 
 
367 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.05 
 
 
350 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10960  ferridoxin oxidoreductase subunit  28.7 
 
 
370 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.25 
 
 
351 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  31.9 
 
 
353 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.97 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5126  vanillate monooxygenase  31.18 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  29.41 
 
 
363 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  33.12 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.87 
 
 
353 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  31.92 
 
 
350 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  31.23 
 
 
350 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  33.91 
 
 
351 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  31.82 
 
 
359 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  31.68 
 
 
370 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.1 
 
 
367 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  31.65 
 
 
423 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  30.11 
 
 
349 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1872  Rieske (2Fe-2S) protein  31.5 
 
 
356 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  27.38 
 
 
357 aa  152  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  31.62 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4273  vanillate monooxygenase  31.69 
 
 
350 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  31.12 
 
 
366 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1004  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  31.03 
 
 
353 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.17 
 
 
359 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6483  Rieske (2Fe-2S) region  29.18 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  30.35 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
365 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  29.53 
 
 
345 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  30.53 
 
 
356 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  27.15 
 
 
366 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  29.71 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  30.6 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1001  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit A  29.28 
 
 
349 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  31.19 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.43 
 
 
362 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0707  Rieske (2Fe-2S) protein  31.1 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  29.06 
 
 
347 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  26.53 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.94 
 
 
353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  29.82 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.37 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  28.95 
 
 
407 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.45 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.77 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>