More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1541 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 1071 aa  2140    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  29.61 
 
 		 834 aa  267  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 		 737 aa  259  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  36.1 
 
 		 532 aa  249  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 677 aa  248  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.2 
 
 		 728 aa  241  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 		 807 aa  231  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  28.74 
 
 		 982 aa  224  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  26.96 
 
 		 1081 aa  222  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  27.24 
 
 		 843 aa  215  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 952 aa  212  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  32.98 
 
 		 537 aa  207  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 896 aa  206  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.28 
 
 		 637 aa  205  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  28.47 
 
 		 680 aa  204  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  34.53 
 
 		 919 aa  200  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 817 aa  199  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.98 
 
 		 700 aa  197  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  26 
 
 		 1589 aa  195  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 1064 aa  195  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 		 553 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.66 
 
 		 564 aa  194  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 		 1969 aa  189  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  31.59 
 
 		 781 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 		 991 aa  186  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 770 aa  185  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  32.25 
 
 		 750 aa  181  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.99 
 
 		 712 aa  181  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 821 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  26.41 
 
 		 994 aa  177  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  28.55 
 
 		 644 aa  174  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 		 1059 aa  172  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  30.14 
 
 		 1216 aa  162  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.89 
 
 		 912 aa  160  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 		 1073 aa  158  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 1093 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 1093 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 858 aa  156  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 1260 aa  153  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.06 
 
 		 1021 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 792 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  30.75 
 
 		 524 aa  148  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1418 aa  147  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.9 
 
 		 598 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 883 aa  144  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.05 
 
 		 1079 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  25.18 
 
 		 754 aa  138  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 1676 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 3706 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 1391 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.44 
 
 		 1143 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.44 
 
 		 1143 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 2693 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 786 aa  130  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 1267 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 904 aa  128  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1611 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 654 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 688 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.81 
 
 		 879 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 1578 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1808 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 767 aa  120  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.86 
 
 		 242 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 752 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 1363 aa  116  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 1516 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 1166 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 1166 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 1428 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  34.9 
 
 		 429 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 666 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 		 1297 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.63 
 
 		 1419 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  25 
 
 		 1041 aa  112  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1559 aa  112  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 1532 aa  111  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.67 
 
 		 251 aa  111  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 1042 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 891 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 1016 aa  110  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 1177 aa  110  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 639 aa  109  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 		 694 aa  109  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 1224 aa  109  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 798 aa  109  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.97 
 
 		 1791 aa  109  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 1002 aa  108  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1927 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 1066 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 1069 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 841 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1548 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 1354 aa  106  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 		 1977 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 1178 aa  106  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.09 
 
 		 1260 aa  106  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 991 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  24.71 
 
 		 1561 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.43 
 
 		 233 aa  105  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>