More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0818 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
315 aa  617  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  85.58 
 
 
319 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  73.73 
 
 
319 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  71.97 
 
 
317 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  72.56 
 
 
328 aa  421  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  46.75 
 
 
328 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  43.79 
 
 
331 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  47.06 
 
 
328 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  43.17 
 
 
328 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  46.6 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  43.52 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 
331 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 
337 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 
340 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 
337 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
337 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.45 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 
436 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  39.1 
 
 
431 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 
436 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  41.11 
 
 
436 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  36.68 
 
 
423 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.37 
 
 
429 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  34.15 
 
 
428 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  33.54 
 
 
418 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  36.53 
 
 
739 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  31.37 
 
 
441 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 
428 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 
353 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
439 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
431 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  32.71 
 
 
424 aa  158  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  37.08 
 
 
436 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 
436 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 
439 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 
353 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 
431 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.47 
 
 
432 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 
410 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  34.57 
 
 
441 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 
349 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 
431 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 
431 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 
436 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 
431 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 
431 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 
431 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 
431 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
438 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 
431 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  35.91 
 
 
720 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 
347 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.22 
 
 
431 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
432 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 
347 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 
436 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 
425 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 
439 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 
431 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 
431 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  33.86 
 
 
431 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
431 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
417 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
431 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
431 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
417 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 
438 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 
431 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 
431 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 
440 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  34.88 
 
 
427 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  33.54 
 
 
431 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 
431 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
431 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  34.11 
 
 
431 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 
433 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  42.61 
 
 
439 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 
428 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
422 aa  149  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 
436 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 
440 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  38.43 
 
 
359 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 
433 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 
440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  36.89 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  34.15 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 
440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
432 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 
445 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  34.97 
 
 
432 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  41.7 
 
 
432 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 
428 aa  146  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 
441 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  33.95 
 
 
417 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>